由2046位黨代表所選出的210位中央委員,雖然並無法藉當上中央委員來獲取到政治實權,其在制度上的意義也僅止於具資格挑戰並成為能代其執行中央委員會職權的中常委。不過由於涉及後馬時代的權力重組,所以即使中央委員僅屬虛職,但此次中央委員選舉仍異常激烈。媒體版面也不時出現此次選舉關於換票、送禮、餐宴的報導,引發不少爭議。其中,中央委員參選人之一的連勝文就公開砲打中央,認為國民黨一年12個月有10個月在內耗,不管是制度缺陷或是有人私心運作,黨要嚴厲檢討,不能讓事情繼續發生;前立委孫大千更炮打吳敦義,贊同連勝文內耗十個月的說法,認為國民黨會遭到人民唾棄;前主席吳伯雄雖然沒有批評黨中央,不過也公開表示目前中央委員的制度是有所問題的。
也就是說,由於中常會在制度設計上接近於內閣制,因此並無監督功能,而其決策、執行功能又由黨主席取代,因此最後中常會就成為目前所看到,既無監督、也無決策,行禮如儀、定位不彰的組織。
總結來說,國民黨目前許多問題都並非是一人一時一地的表面問題,而屬於過往歷史遺留下的制度性問題。因此若國民黨想要重返執政,就必須推動「制度再造」,將黨內制度做一通盤性的改革,不能像過去般,遇有爭議才進行特定改革,進而讓這些改革與未改革到的舊有制度存有結構上的矛盾。也就是說,特定爭議引起特定改革,然而特定改革雖然解決特定問題,但卻又製造出新的問題。此外,由於通盤性的制度再造,事關重大,必然將改變許多既有的政治生態,所以並不能貿然推動,而必須尋求一定共識。如此一來,或許召開前所未有的「黨是會議」,給予黨內各方發表意見的管道,來推動國民黨的制度再造,就會是值得參考的選擇方案之一。並且,這同時也符合當前黨中央的革新.團結.重返執政的口號和形象。
雖然黨主席獨任制,或是總統制類型的權力運行系統有上述種種缺點,不過這並不意味必須貿然改為中常會合議制,或是內閣制類型的權力運行系統。要徹底解決國民黨當前的制度性問題,除了權力運行架構外,也必須有良好、完整的配套制度。進一步言,要轉為中常會合議制,首先就必須處理黨主席的角色問題。因為黨主席乃全體黨員直選而成,因此其自然具有高於黨內其他人的權威。